Le deep learning afin d’identifier et de classer les tumeurs au cerveau
Des chercheurs des Centres médicaux universitaires d’Amsterdam, du Centre d’oncologie pédiatrique Princess Máxima et de l’UMC Utrecht ont développé un réseau neuronal, Sturgeon, qui accélère l’identification des tumeurs du cerveau pendant la chirurgie. Le cancer du système nerveux central (SNC) est particulièrement grave chez les enfants, et le diagnostic précis de la tumeur n’est généralement disponible qu’une semaine après la chirurgie. Sturgeon utilise l’apprentissage par transfert pour permettre la sous-classification moléculaire des tumeurs malignes du SNC en temps réel. Lors de 25 interventions chirurgicales, le réseau a fourni un diagnostic en moins de 90 minutes, permettant aux neurochirurgiens d’ajuster leurs stratégies chirurgicales. Cette approche pourrait éviter des interventions chirurgicales supplémentaires en fournissant une identification plus rapide et plus précise des tumeurs.
Le Professeur Eelco Hoving, neurochirurgien pédiatrique et directeur clinique de neuro-oncologie au Centre Máxima, explique que la technique permet d’éviter des risques et du stress pour les patients et leurs familles, car le type de tumeur est connu lors de la première intervention. Les chercheurs ont utilisé la technologie de séquençage Nanopore pour lire l’ADN en temps réel et ont entraîné un système de quatre réseaux neuronaux à analyser en temps réel et classifier ces séquences. Le modèle Sturgeon résultant ne prend que quelques secondes pour fonctionner sur un ordinateur portable. Testé sur les échantillons prélevés lors de 25 interventions, il a correctement classé 18 tumeurs, montrant un potentiel significatif pour une identification rapide des types de tumeurs cérébrales pendant la chirurgie.
En utilisant la technologie de séquençage Nanopore, les chercheurs ont développé un réseau neuronal, Sturgeon, qui permet une classification moléculaire en temps réel des tumeurs malignes du cerveau. Lors de tests pendant 25 interventions chirurgicales, Sturgeon a fourni un diagnostic en moins de 90 minutes, offrant aux neurochirurgiens une identification plus rapide des types de tumeurs et la possibilité d’ajuster leurs stratégies chirurgicales pendant l’opération. Cette approche prometteuse pourrait contribuer à éviter des interventions chirurgicales supplémentaires en fournissant une identification plus précise des tumeurs cérébrales dès la première intervention, améliorant ainsi la qualité de vie des patients.